Первоначальное решение о создании Североевразийского климатического центра (СЕАКЦ) было принято на 18-й Сессии Межгосударственного совета по гидрометеорологии (МСГ) Содружества независимых государств (СНГ: Армения, Азербайджан, Беларусь, Грузия, Казахстан, Кыргызстан, Молдова, Россия, Таджикистан, Туркменистан, Узбекистан, Украина), проходившей 4-5 апреля 2007 года в Таджикистане в г.Душанбе. Цель создания Центра - климатическое обслуживания стран СНГ. 19-я сессия МСГ (16-17 октября 2007 года, г.Обнинск, Россия) утвердила Положение о центре. На 20-й сессии МСГ (8-9 октября 2008 г., г.Кишинев, Молдова) был утвержден Совет директоров Северо-Евразийского регионального климатического центра и назначен Исполнительный директор СЕАКЦ. С 2009 года СЕАКЦ ведет практическую деятельность.
СЕАКЦ выполняет функции одного из узлов Региональной климатической сети в регионе РА-VI (Европа) со специализацией в области долгосрочных прогнозов.
В РА-II (Азия) СЕАКЦ работает в качестве Многофункционального регионального климатического центра.
